Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms