Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LETMD1Q6P1Q0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms