Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms