Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCSD1Q6JBY9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCSD1Q6JBY9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms