Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL3Q6DD88 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms