Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTY2D1Q68D10 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTY2D1Q68D10 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms