Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms