Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFI1BQ5VTD9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms