Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms