Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFHC1Q5JVL4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms