Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD3Q5JV73 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms