Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITRM1Q5JRX3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITRM1Q5JRX3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms