Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC3LQ587J8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms