Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C4orf17Q53FE4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms