Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms