Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00303Q3SY05 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms