Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT24Q2M2I5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT24Q2M2I5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms