Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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