Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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NDUFA9Q16795 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NDUFA9Q16795 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA9Q16795 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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