Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NTRK2Q16620 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms