Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM1Q16610 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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