Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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