Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP3Q15836 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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