Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-206ENST00000456204 660 ntTSL 36.7□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SDCCAG8-206ENST00000482234 549 ntTSL 36.49□□□□□ -1.378e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-212ENST00000435794 3511 ntTSL 56.4□□□□□ -1.398e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NFX1-202ENST00000379521 3609 ntTSL 1 (best)6.12□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 25.91□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.518e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SSB-209ENST00000470621 440 ntTSL 35.51□□□□□ -1.538e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.568e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-207ENST00000433733 411 ntTSL 54.98□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZFYVE16-211ENST00000512558 4496 ntTSL 24.8□□□□□ -1.648e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SSB-211ENST00000490914 754 ntTSL 54.54□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 RPL7-207ENST00000466821 679 ntTSL 24.46□□□□□ -1.78e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PDSS1-203ENST00000473224 561 ntTSL 54.13□□□□□ -1.758e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.03□□□□□ -1.768e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAP4K4-215ENST00000489490 362 ntTSL 33.36□□□□□ -1.878e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-214ENST00000577363 282 ntTSL 53.03□□□□□ -1.928e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.958e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-210ENST00000503773 3031 ntTSL 52.86□□□□□ -1.958e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZFYVE16-203ENST00000507548 308 ntTSL 32.54□□□□□ -28e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CCDC93-205ENST00000466171 477 ntTSL 32.42□□□□□ -2.028e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.048e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NIPSNAP2-209ENST00000472404 250 ntTSL 51.52□□□□□ -2.178e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.248e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.268e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.298e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZC3H18-205ENST00000564341 387 ntTSL 512.61□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZC3H18-208ENST00000566496 1949 ntTSL 211.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 HDAC10-217ENST00000496235 885 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 214.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PI4KA-217ENST00000492581 3925 ntTSL 211.81□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CMIP-207ENST00000565680 556 ntTSL 413□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.981e-8■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 MYL4-205ENST00000570772 582 ntTSL 38.77□□□□□ -1.015e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 58.41□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 COPG1-202ENST00000504350 672 ntTSL 36.4□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 422.37■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 419.62■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 417.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 514.47□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 32.6
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SF3B4Q15427 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 311.33□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 310.92□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 NUP85-220ENST00000583070 907 ntTSL 59.68□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 NUP85-206ENST00000577645 869 ntTSL 38.95□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 NUP85-212ENST00000579557 817 ntTSL 58.55□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 518.27■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 03e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-202ENST00000369087 1566 ntTSL 26.46□□□□□ -1.384e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TIAL1-209ENST00000470781 1727 ntTSL 25.14□□□□□ -1.593e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 212.77□□□□□ -0.377e-27■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PKD1-216ENST00000483731 4193 ntTSL 512.05□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 LRCH4-207ENST00000487697 756 ntTSL 38.66□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TAZ-204ENST00000470127 272 ntTSL 516.95■□□□□ 0.37e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 HDAC10-220ENST00000497952 976 ntTSL 59.86□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 ADAM10-214ENST00000559053 541 ntTSL 48.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 212.53□□□□□ -0.44e-15■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLEKHA4-206ENST00000595867 766 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLEKHA4-205ENST00000594195 616 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 02e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-201ENST00000325139 1087 ntTSL 222.61■■□□□ 1.214e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-202ENST00000391881 1546 ntTSL 519.51■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-206ENST00000462117 540 ntTSL 417.45■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-205ENST00000460595 1026 ntTSL 313.49□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 32.6
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