Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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