Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A3Q14050 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A3Q14050 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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