Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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