Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms