Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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