Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FOXE3Q13461 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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