Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDC16Q13042 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC16Q13042 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms