Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCB1Q12824 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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