Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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