Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR3Q06889 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms