Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms