Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms