Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms