Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIM1P81133 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIM1P81133 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms