Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRPXP78539 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SRPXP78539 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SRPXP78539 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SRPXP78539 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRPXP78539 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SRPXP78539 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SRPXP78539 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPXP78539 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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