Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX5P78411 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX5P78411 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms