Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IP78347 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IP78347 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms