Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB1P62873 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms