Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UFM1P61960 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UFM1P61960 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms