Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFRD-1P60508 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms