Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFRA1P56159 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms