Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ELLP55199 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ELLP55199 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ELLP55199 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms