Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AQP4P55087 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AQP4P55087 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AQP4P55087 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AQP4P55087 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AQP4P55087 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AQP4P55087 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms