Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCL1P53675 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCL1P53675 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms