Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms