Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPAP49450 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPAP49450 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CENPAP49450 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CENPAP49450 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPAP49450 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPAP49450 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPAP49450 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPAP49450 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms